Sci Adv:没有证据大力支持哺乳动物中细菌表观遗传标记的存在

2021-12-20 01:13:26 来源:
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导言:在一时期阶段,自然就开始了在不改变生若无体细胞会DNA组织以此类推的此前提下来使其DNA把握不同的功能,而这就是通过给DNA位点上添加化学标有来实现的。DNA烷基化是两栖类的关键密切相关表现型程序,其中都5-烷基胞嘧啶(5mc)是最少见的DNA润色之一。6mdA是生若无体一般来说润色该系统的大体一组成分,目此前在两栖类中都欠缺已知的一般来说润色该系统。先此前有不少数据分析报道,6mdA也实际上于两栖类中都,但并无证据支持。

近日,在《生若无科学困难重重》上的一项数据分析中都,瑞典林雪平大学的数据分析其他部门得出结论,两栖类细胞会中都实际上生若无体密切相关表现型标有很显然被酸雨了,并且并未所需的证据来证明两栖类中都实际上这种润色。

N6-烷基腺嘌呤(6mdA)是生若无体中都广泛的DNA润色,但最近在两栖类DNA中都也给与了比如真是。然而,数据分析其他部门写到,即使对来自相同两栖类细胞会子类的DNA顺利进行的6mdA分光镜和重元素测量数据分析也不赞同。

为了大幅度揭示6mdA在两栖类谱系规格中都的主导作用,数据分析其他部门透过了体外将人类文明幼稚T专门设计(NTH)细胞会并存为TH细胞会亚群的能力。但是,与先此前的数据分析相反,他们见到TH并存每一次中都6mdA的重元素并未均局变化,并且仔细观察到并存的T细胞会中都的6mdA程度与未烷基化的均原核生若无增为DNA相同,这得出结论6mdA从未以可侦测的程度实际上人类文明T细胞会中都。

他们还深入数据分析了从六个人类文明细胞会系中都萃取的DNA中都的6mdA,并鉴别出两个具有高于背景噪音程度的6mdA程度的细胞会系。出乎意料的是,两种单独的293T细胞会系培养若无具有不同的6mdA程度,这得出结论数据分析其他部门仔细观察到的6mdA信号并非细胞会子类本身固有的。或许,当他们大幅度看时,他们见到两条6mdA程度升高的细胞会系被感染官能旧称酸雨,感染官能旧称一种少见的生若无体细胞会培养若无中都富含6mdA的酸雨若无。当他们用感染官能特异官能类固醇Plasmocin处理过程细胞会系时,6mdA信号降低为A阴官能对照。

“我们察觉到通过这些新技术侦测到的6mdA'信号'只是噪音。但是,由于一些复杂的新技术问题,几种新方法中都的背景噪音不是随机的,而是真实信号。”Senior著者Colm Nestor(科尔姆·内斯特)在一份声明中都真是。

数据分析其他部门深入数据分析了以此前通过DNA免疫沉淀测序、质谱和单原子即时测序在两栖类细胞会中都定位或侦测6mdA的努力。人们见到每种新方法都有在实践中或缺陷,使密切相关表现型标有的假非典型见到率极低,似乎得出结论林雪平数据分析其他部门视为不实际上这种情形的证据。

这组著者写到:“我们证明,RNA和生若无体酸雨、抗体交叉反应官能和其他新技术限制的融合已造成了6mdA在两栖类DNA中都的每一次有误辨别。随着DNA和RNA润色堂兄弟的迅速增长,以及以此前相符润色的凸显越来越罕有,即使运用于多种互补新方法,我们也强调了有误见到的显然官能。我们建议运用于润色和未润色的原核生若无DNA基准作为今后对罕有DNA润色的数据分析的最低促请,以及在运用于此前格外均面地验证抗体特异官能。”

内斯特补充真是,数据分析其他部门在数据分析极为罕有的情形时只能极为小心,选取运用于哪种新方法,并考虑他们是否只不过在衡量标准实际上的事若无。他真是:“现在我们可以无疑地真是两栖类中都不实际上6mdA。关于6mdA,如果数据分析其他部门停止数据分析真正不实际上的两边,则可以节省大量时长和回报,并且避免了很多令人沮丧的事情。”

原始出处:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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